Foi treinado por Jiraya e ainda jovem, liderou uma equipe formada por gennins. Teve um filho com Uzumaki Kushina, chamado Uzumaki Naruto. O Hokage em exercício, Sarutobi, o escolheu como sucessor.

Quando o demônio conhecido como A Raposa de nove caudas atacou Konoha (dizem que quando a maldade dos homens chega no seu ápice a Kyuubi aparece, apesar de Uchiha Madara poder controla-lá), matando muitos ninjas no caminho, O Hokage de Konoha(Minato) antes de selar a Kyuubi no Yoko descobriu que a mesma era controlada por Uchiha Madara, assim para impedir os planos de Madara,Namikaze Minato(Yondaime Hokage) selou um grande parte da kyuubi em Uzumaki Naruto(seu filho) e outra parte em sí mesmo através do jutsu criado por ele mesmo(Shiki Fuujin). Após sua morte, Sarutobi reassumiu o cargo de Hokage.

Fora revelado no Mangá 382, que Minato, ao ler o primeiro livro de seu sensei, Jiraiya, decidiu educar e nomear seu filho como o personagem principal da historia de seu sensei, assim Jiraiya nomeou o filho de Yondaime com o nome de seu personagem principal: Naruto, e desse modo Jiraiya virou padrinho de Naruto. Também foi revelado que ele sabia de alguma coisa muito importante e de acordo com Jiraiya esse foi o motivo de Minato em confiar a Kyuubi no Youko a seu unico filho, Uzumaki Naruto.

Reviravolta do Quarto

Naruto em um momento de desespero e sob a influência da Kyuubi no Youko, tenta libertar o selo que impedia a Kyuubi no Youko de se manifestar com força total com suas nove caudas, o Hokage aparece então na consciência de seu filho para o impedir e explica que o Fuuin o fizesse aparecer em sua consciência caso oito caudas fossem liberadas (que era o que já havia acontecido), ele esperava que esse dia nunca chegasse, ele rezava para não ter que enfrentar a Kyuubi no Youko novamente, comentou também que estava ansioso pelo dia em que poderia ver seu filho crescido ainda que fossem naquelas circunstancias.

Revelações

A Kyuubi grita em fúria querendo enfrentar e rasgar seu selador, mas Minato fala que não irá realizar o desejo dela e pergunta se isso faz sentido para Naruto. Este fica supreso por Minato saber seu nome e pergunta como ele sabe. Minato então fala que foi ele mesmo que deu esse nome a Naruto, porque ele é seu filho. Naruto fica atordoado com a resposta e a Kyuubi grita em fúria. Minato confirma que Naruto é seu filho e Naruto, emocionado, começa a chorar de alegria. A Kyuubi novamente começa a gritar de fúria por ver que o Yondaime é seu pai, e este fala que o Bijuu é realmente muito irritante e diz para irem para outro lugar. Com um estalo eles vão para outro local do inconsiente de Naruto e este continua a chorar. Minato então revela que o Sandaime Hokage (Hiruzen Sarutobi) também sabia que Naruto era filho dele, mas Sarutobi apenas não revelou a Naruto porque queria manter em sigilo o máximo de informações possíveis, pois se soubessem que Naruto era filho do Quarto Hokage, ele viveria em constante perigo. Minato então pede perdão para Naruto, então este o chama de pai pela primeira vez e de repente dá um soco no peito de seu pai, que não esperava e recua alguns passos, Naruto grita chorando perguntando o porque de seu pai ter selado a Kyuubi nele, pois foi muito difícil de viver com isso, Naruto não sabe o que sentir agora que sabe a verdade. Minato então pergunta quantos anos Naruto tem e este fala que tem 16, Minato fica espantado e supõe que seu filho passou por vários problemas. Minato então pede desculpa, mesmo que não possa pedir desculpas como pai, pois só causou dor a Naruto, mas este fala que como é filho do grande Quarto Hokage pode suportar isso, fazendo Minato rir.

Minato revela que ele selou a Kyuubi em Naruto porque tinha fé que seu filho pudesse usar o chakra da raposa e controlá-lo, ele também revela que necessitava selar a Kyuubi em Naruto porque descobriu que quando o Bijuu das Nove Caudas atacou a vila a dezesseis anos, descobriu que alguém estava por trás do ataque da Kyuubi, pois alguém estava manipulando-a, um shinobi com um grande poder anormal que ninguém (sem um poder especial) poderia vencer e termina dizendo que acredita que o mesmo homem ira atacar a vila novamente. Naruto diz que Konoha já está completamente destruída, Minato diz que já sabe disso e também sabe que Jiraiya, seu mestre, foi assassinado, Naruto fica surpreso e diz que deve ter sido Pein que controlou a Kyuubi, mas Minato diz que não foi Pein, Naruto então pergunta quem foi, Minato responde que foi um membro da Akatsuki que usa máscara, então Naruto percebe que foi Tobi, o novo membro da Akatsuki. Minato então revela que na noite que a Kyuubi atacou, ele encontrou o membro da Akatsuki e tentou vence-lo, porém o inimigo viu através de cada jutsu que Minato usou, ele então revela que o inimigo de máscara não é uma pessoa, nem um shinobi comum. Minato diz que tem certeza que Pein está sendo usado pelo homem de máscara, mas Naruto diz que Pein também tem uma rixa pessoal com Konoha, já que a Vila Oculta da Chuva foi destruída certa vez por Konoha no passado.

Minato concorda com que Naruto disse e diz que o homem mascarado tirou vantagem disso. Naruto não entende como Pein pode estar sendo usado e pergunta que se há alguém por trás do ataque ocorrendo a Konoha naquele momento. Minato fica silencioso por alguns momentos e diz que enquanto o Sistema Shinobi Atual existir nunca haverá paz, ele comenta a pergunta que Pein fez a Naruto e diz que única solução para essa pergunta ainda é uma longa jornada para se achar a resposta, ele então diz a mesma coisa que Pein falou para Naruto, mas do jeito certo: que as guerras surgem do desejo de proteger aquilo que é precioso para eles, pois enquanto houver amor, haverá ódio, e o ódio direciona até certo ponto a vida dos shinobis. Minato então termina sua frase dizendo que enquanto esse sistema atual existir sempre nascerão inimigos ou seres como Pein. Yondaime revela que embora Pein seja o assassino de Jiraiya, ele acredita que Jiraiya foi morto pela desordem que criou Pein e não pelo mesmo. Minato então diz que ser shinobi é estar em constante luta com o ódio, pois é uma batalha que todos os ninjas terão que passar. Jiraiya deixou a missão para Naruto responder o que Pein perguntou a ele, mas mesmo assim Naruto diz que não poderá perdoar Pein por tudo o que ele fez. Minato sabe disso e então Naruto pergunta o que ele deve fazer. Minato então responde que essa resposta Naruto terá de descobrir sozinho pois nem mesmo ele sabe. Naruto fica nervoso e pergunta como irá resolver uma coisa que nem o Maior Eremita Pervertido do mundo (Jiraiya), e o considerado maior Hokage da história de Konoha (Yondaime Hokage) conseguiram resolver. Naruto continua gritando dizendo que é loucura uma pergunta como essa, pois ele admite que nunca foi muito inteligente, nem um grande shinobi, mas antes que termine de falar seu pai coloca sua mão na sua cabeça.

Minato diz que Naruto tem esse poder de resolver a pergunta e sorrindo diz que confia em seu filho. Naruto fica surpreso ao ver que o Yondaime, seu pai, confia nele para resolver o enigma, Minato então fala que quando a situação chegar a esse ponto a única coisa a fazer é acreditar em seus filhos, pois é o que os pais fazem. Minato então diz que terá de partir em breve pois ele está sentido seu chakra começar a desaparecer, ele então coloca sua mão na barriga de Naruto e diz que irá refazer o selo, mas esta seria a última vez, em um segundo os 3 selos (o Shisou no Fuuin, Shiki Fuujin e o Hakke no Fuuin Shiki)de Naruto se refazem. Minato então começa a desaparecer e diz que Konoha pode ser reconstruída, contando com Naruto e por fim desaparece. Naruto então com sua Determinação do Fogo recuperada agradece a seu pai. Naruto continua e consegue fazer Pein se arrepender e usar um jutsu que ressuscita as pessoas que morreram na batalha.

Ninjutsus:

Rasengan, Kage Bunshin no Jutsu, Tajuu Kage Bunshin no Jutsu

Técnicas Básicas:

Bunshin no Jutsu, Kawarimi no Jutsu

Técnicas Elementais:

Raiton no Jutsu, Hiraishin no Jutsu, Raiton - Hiraishin Rasengan, Raiton - Jibashi, Raiton - Shichuu Shibari, Raiton - Maisou, Raiton - RaiKage Bunshin no Jutsu Katon no Jutsu, Gama Yuendan

Técnicas de Invocação:

Ninpou: Bahagran no Jutsu, Ninpou: Kuchiyose no Jutsu, Kuchiyose • Gama, Gama Bunta, Paw & Maw, Gama Kii, Gamaguchi Shibari, Gamaken, Gamahiro, Kuchiyose • Shinigami

Fuuinjutsus:

Hakke no Fuuin Shiki

Shiki Fuujin, Shishou Fuuin

Taijutsus:

Hokage Ryuu, Taren Ken/Taren Kyaku